Alinhamento múltiplo e filogenia

    Numa útlima fase de análise sobre os genes, destacam-se os que não tém função indefinida e para tal, procede-se a uma análise filogenética entre este conjunto de genes com função desconhecida e um conjunto de genes com função bem definida através das análises anteriormente efectuadas. Salienta-se que o conjunto de genes com função bem definida que utilizou-se foram os obtidos pela base de dados Swiss Prot, uma vez que esta base de dados permitiu obter informação mais fidedigna e esclarecedora à cerca das especificidades dos genes em estudo e assim comparar filogeneticamente com os genes de função desconhecida.

    Para a realização deste trabalho utilizou-se o software MEGA e obteve-se a árvore filogenética com cada gene de função desconhecida. Obviamente que quanto maior a proximidade filogenética maior a probabilidade de os genes em questão partilharem a mesma função.

    No software MEGA foram utilizados tanto para os genes de função conhecida, como para os genes de função desconhecida a versão FASTA recolhida através da base de dados do NCBI.

    Analisamos 5 genes com função desconhecida uma vez que eram muitos os genes de função desconhecida, mais propriamente na ordem dos 82 genes. Claramente, os outros genes que não estão aqui constatados, ao serem analisados filogeneticamente seguiriam o mesmo conceito que a análise feita. Os 5 genes analisados com função desconhecida são os assinalados com cor preta na tabela obtida nas alterações obtidas do mapeamento inicial, após a análise mais profunda.

    Mais uma vez, constata-se que a zona genómica que o nosso grupo ficou encarregue de analisar possui muitos conjuntos de genes não caracterizados à cerca das suas especificidades.

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Proteína(s) com semelhança(s) evolutiva(s): UPF0758_protein e proteína sidD
Provável(veis) função(ões) associadas à desconhecida (respectivamente): processamento de DNA e RNA(reparação, replicação, transcrição, degradação e modificação) e produção de toxinas ou outras funções patogénicas

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