Análise da literatura
Para ser possível a elaboração deste trabalho, foi necessária uma pesquisa quer de artigos científicos, quer de outro tipo de documentos acerca da Legionella, para um melhor conhecimento da mesma; ou seja, procedeu-se primeiro a uma pesquisa manual, útil e necessária sobre a Legionella.
Abaixo encontram-se alguns dos artigos que permitiram ao grupo descobrir algumas informações gerais sobre a Legionella - que podem ser observadas no separador "LEGIONELLA" -, com os respectivos autores:
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Artigo |
Autores |
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Molecular Pathogenesis of Infections Caused byLegionella pneumophila |
Hayley J. Newton Desmond K. Y. Ang Ian R. van Driel Elizabeth L. Hartland |
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The novel Legionella pneumophilatype II secretion substrate NttC contributes to infection of amoebaeHartmannella vermiformis andWillaertia magna |
Jessica Y. Tyson Paloma Vargas Nicholas P. Cianciotto |
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Environmental culturing for Legionella: Can we build a better mouse trap? |
Janet E. Stout, PhD Victor L. Yu, MD |
No decorrer da realização do trabalho, verificou-se que era necessário artigos mais restritos, por isso, para tal, foi desenvolvido um código que, de um vasto conjunto de artigos sobre a Legionella, procura aqueles que falem apenas da estirpe em questão (Legionella pneumophila philadelphia 1). Sendo assim, segue-se abaixo o código que permite a procura dos artigos e, num ficheiro de texto, os artigos encontrados, bem como os respectivos autores e fontes.
Script para procura de artigos ("artigoslegionella.py")
www.dropbox.com/s/6ypwv2uvso3idz6/artigoslegionella.py?dl=0
Ficheiro "ArtigosLegionella.txt"
Especificações gerais sobre a legionella
Da análise feita através da plataforma PATRIC, o grupo encontrou algumas especificações gerais sobre o genoma da Legionella que se seguem nas tabelas abaixo.
Genoma Summary
O grupo conseguiu ainda encontrar um mapa circular do genoma da Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1. Este mapa mostra anotações genómicas e propriedades da sequência.
Legenda do mapa genómico circular (de dentro para fora):
- Chromosomes / Plasmids / Contigs,
- CDS, forward strand,
- CDS, reverse strand,
- NAs,
- GC Content, line Plot,
- GC Skew, line Plot